Origine du nom
Le Père Nicolas Malebranche (1638 - 1715), oratorien et philosophe français ; quartier des Ecoles.
Histoire de la rue
Précédemment partie de la rue Paillet dans le tronçon A et de la rue Saint-Thomas d'Enfer dans le tronçon B. L'ancienne rue Paillet a successivement porté les noms de rue du Rempart, rue des Fossés, rue des Fossés Saint-Michel et rue Saint-Hyacinthe-Saint-Michel.
Ouverture de la rue
Lettres patentes du 7 juillet 1646, entre les rues Saint-Jacques et Paillet (A). Lettres patentes du 18 mars 1546, le surplus (B).